Using textscan to extract values from a text file

I have the following text file:

 Leaf Tips:2867.5,1101.66666666667 2555,764.166666666667 2382.5,1221.66666666667 2115,759.166666666667 1845,1131.66666666667 1270,991.666666666667 Leaf Bases:1682.66666666667,800.333333333333 1886,850.333333333333 2226,920.333333333333 2362.66666666667,923.666666666667 2619.33333333333,967 Ear Tips:1029.33333333333,513.666666666667 1236,753.666666666667 Ear Bases:1419.33333333333,790.333333333333 1272.66666666667,677 

These are coordinates to regions of interest for each category in an image. I need to extract these regions. I know I have to use textscan to accomplish this but I am unsure of the formatspec options needed to achieve this, since whichever setting I use seem to give me some jumbled form of cell output.

What formatSpec should I use so that I get the coordinates of each region outputed in a cell?

I've tried the following:

file = '0.txt';
fileID = fopen(file);
formatSpec = '%s %f %f %f %f %f %f %f %f';
C = textscan(fileID, formatSpec, 150, 'Delimiter', ':'); 
4

2 Answers

Here's an example of what you can do:

fid = fopen('0.txt'); % open file
T = textscan(fid, '%s','Delimiter',':'); % read all lines, separate row names from numbers
fclose(fid); % close file
T = reshape(T{1},2,[]).'; % rearrange outputs so it makes more sense
T = [T(:,1), cellfun(@(x)textscan(x,'%f','Delimiter',','), T(:,2))]; % parse numbers

Which will result in a cell array as follows:

T = 4×2 cell array {'Leaf Tips' } {12×1 double} {'Leaf Bases'} {10×1 double} {'Ear Tips' } { 4×1 double} {'Ear Bases' } { 4×1 double}
0

This is how I would do it:

fid = fopen('file.txt');
x = textscan(fid,'%s', 'Delimiter', char(10)); % read each line
fclose(fid);
x = x{1};
x = regexp(x, '\d*\.?\d*', 'match'); % extract numbers of each line
C = cellfun(@(t) reshape(str2double(t), 2, []).', x, 'UniformOutput', false); % rearrange

Result:

>> celldisp(C)
C{1} = 1.0e+03 * 2.867500000000000 1.101666666666670 2.555000000000000 0.764166666666667 2.382500000000000 1.221666666666670 2.115000000000000 0.759166666666667 1.845000000000000 1.131666666666670 1.270000000000000 0.991666666666667
C{2} = 1.0e+03 * 1.682666666666670 0.800333333333333 1.886000000000000 0.850333333333333 2.226000000000000 0.920333333333333 2.362666666666670 0.923666666666667 2.619333333333330 0.967000000000000
C{3} = 1.0e+03 * 1.029333333333330 0.513666666666667 1.236000000000000 0.753666666666667
C{4} = 1.0e+03 * 1.419333333333330 0.790333333333333 1.272666666666670 0.677000000000000
3

Your Answer

Sign up or log in

Sign up using Google Sign up using Facebook Sign up using Email and Password

Post as a guest

By clicking “Post Your Answer”, you agree to our terms of service, privacy policy and cookie policy

You Might Also Like